Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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