Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx3P70354 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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