Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms