Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms