Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms