Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmoP56726 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmoP56726 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmoP56726 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmoP56726 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmoP56726 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmoP56726 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmoP56726 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmoP56726 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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