Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpcP51612 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpcP51612 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms