Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VdrP48281 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VdrP48281 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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VdrP48281 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VdrP48281 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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