Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms