Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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