Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc10P31257 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxc10P31257 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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