Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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