Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VimP20152 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VimP20152 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VimP20152 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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