Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms