Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04214 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04214 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P04214 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms