Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Ab1P01921 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms