Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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