Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms