Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

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Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Vmn2r40F6W043 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn2r40F6W043 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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