Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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