Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmod3E9QA62 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms