Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb3D3Z6J4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms