Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms