Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a6B1AVK5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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