Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms