Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Shisal2aA2A9G7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms