Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms