Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Nme3Q9WV85 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Nme3Q9WV85 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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