Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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