Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Col4a3Q9QZS0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col4a3Q9QZS0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col4a3Q9QZS0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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