Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nr2e3Q9QXZ7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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