Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms