Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Mrpl39Q9JKF7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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