Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms