Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tmco5aQ9D9D5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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