Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms