Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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