Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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