Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rpusd4Q9CWX4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rpusd4Q9CWX4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rpusd4Q9CWX4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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