Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms