Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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