Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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