Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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