Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klc3Q91W40 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms