Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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