Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms