Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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