Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp1Q8BJQ2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms