Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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