Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms